Den Startpunkt für die Erfolgsgeschichte des COMBI setze die erste Generation im Jahr 2000. Schon damals verfügte der FABIA COMBI über ein Navigationssystem, einen Tempomat, eine elektronische Stabilitätskontrolle (ESC) und Parksensoren am Heck. Eine weitere Besonderheit der ersten Generation war die Nutzfahrzeugvariante PRAKTIK. Diese hatte hinter den 2 Vordersitzen einen fest abgetrennten Laderaum. Insgesamt wurden von der ersten Generation des FABIA COMBI 574.600 Einheiten gebaut.
Ab der zweiten Generation war auch für den COMBI die von anderen ŠKODA Modellen bekannte Modellvariante SCOUT verfügbar. Die in Silber und Grau gehaltenen Kunststoffapplikationen an Front und Heck, die Radhausverkleidungen sowie die Seitenschwellern sorgten für den bekannten robusten Look des Modells. Highlights der zweiten Generation waren die Modelle RS und MONTE CARLO.
Das vom SCOUT bekannte Schlechtwege-Paket mit erhöhter Bodenfreiheit wurde später für die dritte Generation des COMBI übernommen und war dort für die frontgetriebene SCOUTLINE verfügbar. Weitere Neuheiten für die dritte Generation waren unter anderem die PDC für vorne, das automatische Schließ- und Startsystem „Kessy“ sowie komplett neu konzipierte Infotainmentsysteme, die eine Einbindung des Smartphones ins Auto ermöglichten.
Der ŠKODA SCALA verfügt über ähnliche Qualitäten und aktuelle Sicherheitsstandards. Der FABIA COMBI und der SCALA verfügen über ähnliche Gepäckraumvolumina: Bei umgeklappter Rücksitzbank hat der SCALA sogar die Nase vorne.
